Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PDE4DQ08499 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDE4DQ08499 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms