Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms