Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms