Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms