Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms