Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DSG1Q02413 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms