Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BNC1Q01954 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms