Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
IFITM3Q01628 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms