Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms