Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
RPS4XP62701 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RPS4XP62701 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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