Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NUP98P52948 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NUP98P52948 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms