Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DAP3P51398 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DAP3P51398 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DAP3P51398 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms