Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGER3P43115 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms