Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms