Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LTBRP36941 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LTBRP36941 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms