Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP7BP35670 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms