Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSFA2P28290 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms