Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IL3RAP26951 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms