Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FGFR3P22607 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms