Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NF1P21359 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NF1P21359 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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NF1P21359 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NF1P21359 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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