Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM21P19474 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms