Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTLA4P16410 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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