Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms