Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ODC1P11926 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms