Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms