Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI3P10071 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI3P10071 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI3P10071 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms