Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERPIND1P05546 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms