Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVV-1B6SEH8 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms