Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SOBPA7XYQ1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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