Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
USP24Q9UPU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP24Q9UPU5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP24Q9UPU5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms