Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THUMPD1Q9NXG2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
THUMPD1Q9NXG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms