Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
KCNIP2Q9NS61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
KCNIP2Q9NS61 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms