Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIK2Q9H0K1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIK2Q9H0K1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SIK2Q9H0K1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SIK2Q9H0K1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms