Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACTR3CQ9C0K3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ACTR3CQ9C0K3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms