Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHF23Q9BUL5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PHF23Q9BUL5 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHF23Q9BUL5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms