Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNPY3Q9BT09 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNPY3Q9BT09 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNPY3Q9BT09 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNPY3Q9BT09 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms