Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CENPKQ9BS16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
CENPKQ9BS16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CENPKQ9BS16 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CENPKQ9BS16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms