Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHOXF2Q9BQY4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHOXF2Q9BQY4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHOXF2Q9BQY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms