Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RMDN3Q96TC7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RMDN3Q96TC7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RMDN3Q96TC7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RMDN3Q96TC7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms