Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H4Q96RI1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1H4Q96RI1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NR1H4Q96RI1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138 ms