Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ELP4Q96EB1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ELP4Q96EB1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ELP4Q96EB1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms