Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HPS3Q969F9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HPS3Q969F9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HPS3Q969F9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HPS3Q969F9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms