Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTW3

COG1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG1Q8WTW3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COG1Q8WTW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
COG1Q8WTW3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG1Q8WTW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms