Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC112Q8NEF3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC112Q8NEF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC112Q8NEF3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms