Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCT2Q8NC54 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCT2Q8NC54 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCT2Q8NC54 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms