Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9G6

Putative UPF0607 protein FLJ37424, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N9G6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8N9G6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8N9G6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8N9G6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q8N9G6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q8N9G6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q8N9G6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q8N9G6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q8N9G6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q8N9G6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q8N9G6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8N9G6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q8N9G6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q8N9G6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q8N9G6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q8N9G6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q8N9G6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8N9G6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8N9G6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8N9G6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q8N9G6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q8N9G6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8N9G6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q8N9G6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms