Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF550Q7Z398 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF550Q7Z398 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF550Q7Z398 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms