Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARA5Q6ZMJ2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCARA5Q6ZMJ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCARA5Q6ZMJ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCARA5Q6ZMJ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms