Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPH2Q6IBW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NCAPH2Q6IBW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPH2Q6IBW4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms