Protein–RNA interactions for Protein: Q4KN68

LINC01620, Uncharacterized protein encoded by LINC01620, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01620Q4KN68 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01620Q4KN68 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC01620Q4KN68 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms